九頭竜川の基準地点である中角地点の水質は、基準値2.0mg/リットル以下のBOD75％値で1.0mg/リットル前後で推移している。
　日野川深谷地点の水質は、環境基準値近くのBOD75％値で３mg/リットル前後で推移している。平成７年以降は２mg/リットル以下である。平成６年は、大渇水年であったため3.6mg/リットルと非常に高い値となった。
　主要地点の水質変化を示すと、図5.1.8のとおりである。なお、建設省データは75％値であるが、福井県データは年平均値である。